Das Nationalpark-Haus Baltrum liegt unübersehbar etwa 150 Meter vom Hafen entfernt, direkt auf dem Weg vom Anleger zum Ort . Als einziges Nationalpark-Haus an der niedersächsischen Küste liegt es auf einer erhöhten Wurt vor der schützenden Dünen- und Deichlinie und ist so dem Einfluss von Ebbe und Flut unmittelbar ausgesetzt
Es wurde 1987 im ehemaligen Gebäude der örtlichen Reederei (Baltum-Linie) eröffnet. Die gemeinsame Initiative der Inselgemeinde Baltrum, der Nationalparkverwaltung und der Schutzgemeinschaft Deutsche Nordseeküste SDN e.V. ermöglichte den Umbau zu einer Informationseinrichtung des Nationalparks Niedersächsisches Wattenmeer. Tatkräftig unterstützt wurde der Umbau und Ausbau von dem damaligen Staatlichen Amt für Insel- und Küstenschutz (heute NLWKN) und einem Nordseehaus Freundeskreis (heute Heimatverein Baltrum).
Seit Januar 2004 betreibt der BUND zusammen mit der Gemeinde das attraktive Haus.
Jährlich informieren sich rund 35.000 BesucherInnen über die natürlichen Lebensräume der Insel und das Wattenmeer und nehmen an den verschiedenen Veranstaltungen teil, die das Nationalparkhaus anbietet.
Das kompetente Team des Hauses legt großen Wert auf erlebnisorientierte Umweltbildung für alle Altersgruppen und jedes Anspruchsniveau.